Publiée 12 juin 2026
Doctorant.e en phytochimie et imagerie spectrale en CDD (H/F)
Junia
Lille, Hauts-de-France 59000, France
CDI
Depuis 1885, JUNIA, affiliée à l'Université Catholique de Lille, forme des ingénieurs prêts à relever les grandes transitions et les défis de demain. Grâce à ses programmes emblématiques HEI, ISA et ISEN, JUNIA développe une expertise pluridisciplinaire couvrant l'industrie, le numérique, l'agroalimentaire, les agricultures, la santé et l'environnement.
Bien plus qu'un établissement d'enseignement supérieur et de recherche, JUNIA est aujourd'hui un acteur économique et social engagé. Elle forme des ingénieurs responsables, et des acteurs du monde de demain (au travers de son offre de formation JUNIA XP) capables de mobiliser des savoirs scientifiques pour répondre aux enjeux complexes de la société.
Reposant sur une pédagogie active et collaborative, JUNIA valorise les projets collectifs et des connexions fortes avec le monde de l'entreprise. Cette approche, enrichie par une vie associative dynamique, joue un rôle central dans la formation d'ingénieurs et de talents compétents, ouverts sur le monde et porteurs de valeurs humanistes.
Ce qui nous caractérise :
Une polyvalence des missions, un contact étroit avec les étudiants, une recherche appliquée et transdisciplinaire, une forte proximité avec les entreprises et une implication dans l'innovation pédagogique.
Chiffres clés :
4 000 étudiants / 35 000 diplômés / 400 salariés permanents JUNIA / 3 campus (Lille, Châteauroux, Bordeaux) / 40 domaines de spécialisations / 65 nationalités (étudiants et professeurs) / 5 laboratoires de recherche publics régionaux en cotutelle
Envie de rejoindre l'aventure ? #joinjunia
Plus d'informations : junia.com
JUNIA recrute un Doctorant en phytochimie et imagerie spectrale (H/F), quiserarattaché aux laboratoires LITL et BioEcoAgro. La thèse est adossée au projetANR EUROTELL et se déroulera dans le cadre d'une coopération scientifiqueavec la Faculté de Gestion, Économie et Sciences (FGES) de l'UniversitéCatholique de Lille.
Descriptiondu projet de thèse :
Les plantes sont soumises enpermanence à de multiples stresses de nature biotique (agents pathogènes, etc.)et abiotique (sècheresse, excès de température, carence nutritive, etc.).Aujourd'hui, le suivi de l'effet de ces stresses dans le cadre des méthodes delutte (biocontrôle, biostimulation, levier variétal, etc.) repose essentiellementsur des techniques analytiques couteuses et laborieuses, basées sur la biologiemoléculaire (transcriptomique) ou la phytochimie (métabolomique, protéomique,etc.). Cette offre de thèse se situe dans ce contexte et vise, in fine,à développer un outil d'aide à la décision (OAD) basé sur le suivi spectral demarqueurs de l'état physiologique des plantes, en se focalisant sur des espècesvégétales cultivées en milieu indoor, dans le cadre de l'agricultureurbaine ou de la production sous serre en conditions contrôlées. Le premiervolet de la thèse aura pour objectif de déterminer l'existence de corrélationsentre les signatures phytochimiques (métabolomiques) et les signaturesspectrales (multi- et hyper-spectrales) des plantes ciblées, en conditions sansstress et en conditions de stresses biotique et abiotique (appliqués en solo et/ou en combiné). Le deuxième volet, quant à lui, vise à identifier et valider(par des approches analytiques et expérimentales en mode ciblé) des marqueurs spectrauxde stress qui serviront de base à la construction d'un OAD, la finalité duprojet. Enfin, le troisième volet de la thèse consiste à réaliser un suivi desmarqueurs identifiés en conditions de traitement des plantes avec des biomoléculesde biocontrôle et de biostimulation, pour une application éventuelle de l'OAD visédans l'agroécologie et la résilience des cultures au changement climatique.
Ce projet interdisciplinaire nécessite un espritde créativité et une forte d'adaptabilité aux différents champs scientifiquesconcernés par le sujet (phytochimie, biologie, imagerie spectrale), eninteraction avec l'équipe encadrante qui sera disponible et à l'écoute tout aulong du projet. La thèse sera inscrite à l'école doctorale de l'UniversitéPolytechnique des Hauts-de-France (UPHF) et sera adossée au LaboratoireInterdisciplinaire des Transitions de Lille (LITL) et à l'UMR-TransfrontalièreINRAE 1158 BioEcoAgro. Les expérimentations seront essentiellementréalisées au sein des laboratoires et des serres du Palais Rameau de Junia.
Vosmissions :
- Réaliser un état de l'art approfondi sur le sujet de thèse.
- Réaliser les travaux expérimentaux au laboratoire, en chambres de culture et en serre.
- Analyser des données obtenues à l'aide de logiciels de statistique et de modélisation.
- Organiser des réunions régulières avec les encadrants sur l'avancement des travaux.
- Réaliser la synthèse des résultats et les communiquer dans des événements scientifiques.
- Rédiger des publications scientifiques, ainsi que le manuscrit et la soutenance de thèse.
Cette liste est non exhaustive et peut être amenée à évoluer.
Profil :
Contrat de doctorat à pourvoir à compter du 01/09/26 pour une durée de 3 ans, basé à Lille (quartier Vauban).
Rémunération selon les grilles en vigueur.
CV et lettre de motivation àsoumettre avant le 15/04/2026
Le poste sur lequel vous candidatez est susceptibled'être situé dans une « zone à régime restrictif » au sens de l'article R.413-5-1 du code pénal. Si tel est le cas, votre nomination et/ou votreaffectation ne pourront intervenir qu'après autorisation d'accès délivrée parle chef d'établissement, conformément aux dispositions de l'article 20-4 dudécret n°84-431 du 6 juin 1984 ;
A compétences égales, priorité aux travailleurs handicapés et autres bénéficiaires de l'obligation d'emploi
Bien plus qu'un établissement d'enseignement supérieur et de recherche, JUNIA est aujourd'hui un acteur économique et social engagé. Elle forme des ingénieurs responsables, et des acteurs du monde de demain (au travers de son offre de formation JUNIA XP) capables de mobiliser des savoirs scientifiques pour répondre aux enjeux complexes de la société.
Reposant sur une pédagogie active et collaborative, JUNIA valorise les projets collectifs et des connexions fortes avec le monde de l'entreprise. Cette approche, enrichie par une vie associative dynamique, joue un rôle central dans la formation d'ingénieurs et de talents compétents, ouverts sur le monde et porteurs de valeurs humanistes.
Ce qui nous caractérise :
Une polyvalence des missions, un contact étroit avec les étudiants, une recherche appliquée et transdisciplinaire, une forte proximité avec les entreprises et une implication dans l'innovation pédagogique.
Chiffres clés :
4 000 étudiants / 35 000 diplômés / 400 salariés permanents JUNIA / 3 campus (Lille, Châteauroux, Bordeaux) / 40 domaines de spécialisations / 65 nationalités (étudiants et professeurs) / 5 laboratoires de recherche publics régionaux en cotutelle
Envie de rejoindre l'aventure ? #joinjunia
Plus d'informations : junia.com
JUNIA recrute un Doctorant en phytochimie et imagerie spectrale (H/F), quiserarattaché aux laboratoires LITL et BioEcoAgro. La thèse est adossée au projetANR EUROTELL et se déroulera dans le cadre d'une coopération scientifiqueavec la Faculté de Gestion, Économie et Sciences (FGES) de l'UniversitéCatholique de Lille.
Descriptiondu projet de thèse :
Les plantes sont soumises enpermanence à de multiples stresses de nature biotique (agents pathogènes, etc.)et abiotique (sècheresse, excès de température, carence nutritive, etc.).Aujourd'hui, le suivi de l'effet de ces stresses dans le cadre des méthodes delutte (biocontrôle, biostimulation, levier variétal, etc.) repose essentiellementsur des techniques analytiques couteuses et laborieuses, basées sur la biologiemoléculaire (transcriptomique) ou la phytochimie (métabolomique, protéomique,etc.). Cette offre de thèse se situe dans ce contexte et vise, in fine,à développer un outil d'aide à la décision (OAD) basé sur le suivi spectral demarqueurs de l'état physiologique des plantes, en se focalisant sur des espècesvégétales cultivées en milieu indoor, dans le cadre de l'agricultureurbaine ou de la production sous serre en conditions contrôlées. Le premiervolet de la thèse aura pour objectif de déterminer l'existence de corrélationsentre les signatures phytochimiques (métabolomiques) et les signaturesspectrales (multi- et hyper-spectrales) des plantes ciblées, en conditions sansstress et en conditions de stresses biotique et abiotique (appliqués en solo et/ou en combiné). Le deuxième volet, quant à lui, vise à identifier et valider(par des approches analytiques et expérimentales en mode ciblé) des marqueurs spectrauxde stress qui serviront de base à la construction d'un OAD, la finalité duprojet. Enfin, le troisième volet de la thèse consiste à réaliser un suivi desmarqueurs identifiés en conditions de traitement des plantes avec des biomoléculesde biocontrôle et de biostimulation, pour une application éventuelle de l'OAD visédans l'agroécologie et la résilience des cultures au changement climatique.
Ce projet interdisciplinaire nécessite un espritde créativité et une forte d'adaptabilité aux différents champs scientifiquesconcernés par le sujet (phytochimie, biologie, imagerie spectrale), eninteraction avec l'équipe encadrante qui sera disponible et à l'écoute tout aulong du projet. La thèse sera inscrite à l'école doctorale de l'UniversitéPolytechnique des Hauts-de-France (UPHF) et sera adossée au LaboratoireInterdisciplinaire des Transitions de Lille (LITL) et à l'UMR-TransfrontalièreINRAE 1158 BioEcoAgro. Les expérimentations seront essentiellementréalisées au sein des laboratoires et des serres du Palais Rameau de Junia.
Vosmissions :
- Réaliser un état de l'art approfondi sur le sujet de thèse.
- Réaliser les travaux expérimentaux au laboratoire, en chambres de culture et en serre.
- Analyser des données obtenues à l'aide de logiciels de statistique et de modélisation.
- Organiser des réunions régulières avec les encadrants sur l'avancement des travaux.
- Réaliser la synthèse des résultats et les communiquer dans des événements scientifiques.
- Rédiger des publications scientifiques, ainsi que le manuscrit et la soutenance de thèse.
Cette liste est non exhaustive et peut être amenée à évoluer.
Profil :
- Titulaire d'un Bac+5 (Master ou Ingénieur/Bioingénieur) dans l'un des domaines liés à la thèse (biologie ou physiologie végétale, biochimie/chimie du végétal, agronomie, etc.).
- Appétence pour les travaux en laboratoire, les expérimentations végétales en conditions contrôlées et les analyses statistiques.
- Maitrise souhaitée des outils d'analyse chimique et biochimique (HPLC, RMN, IR, UV, etc.).
- Attrait pour les technologies d'imagerie spectrale et les analyses d'image.
- Bonne qualité rédactionnelle et de communication orale.
- Capacité d'organisation, rigueur, autonomie, esprit de synthèse, adaptabilité et curiosité scientifique.
- Bon niveau d'anglais (B2 minimum souhaité).
Contrat de doctorat à pourvoir à compter du 01/09/26 pour une durée de 3 ans, basé à Lille (quartier Vauban).
Rémunération selon les grilles en vigueur.
CV et lettre de motivation àsoumettre avant le 15/04/2026
Le poste sur lequel vous candidatez est susceptibled'être situé dans une « zone à régime restrictif » au sens de l'article R.413-5-1 du code pénal. Si tel est le cas, votre nomination et/ou votreaffectation ne pourront intervenir qu'après autorisation d'accès délivrée parle chef d'établissement, conformément aux dispositions de l'article 20-4 dudécret n°84-431 du 6 juin 1984 ;
A compétences égales, priorité aux travailleurs handicapés et autres bénéficiaires de l'obligation d'emploi
