Publiée 22 juillet 2026
H/F Doctorant en génomique de Caenorhabditis elegans
Centre de Nanosciences et de Nanotechnologies
Paris, Île-de-France 75230, France
CDI
Description du Poste
Sujet De Thèse
Défense et contre-défense entre voies des petits ARN et éléments transposables chez Caenorhabditis elegans
Mission :
Les éléments transposables (ET) sont des parasites génomiques capables de se répliquer et se mouvoir au sein des génomes hôtes. Leur mobilisation constitue une menace persistante pour ces génomes. En réponse, les hôtes ont développé divers mécanismes de défense pour préserver l'intégrité de leur génome. Les interactions hôte-ET sont donc souvent perçues comme une course évolutive aux armements. Cependant, les ET peuvent être cooptés pour des fonctions de l'hôte et ont largement contribué à l'évolution des génomes. Des progrès considérables ont été réalisés dans la caractérisation de la dynamique d'invasion des ET et des voies de répression génique de l'hôte, mais très peu d'études répondent à la question suivante : les ET peuvent-ils contrer activement les mécanismes de défense de l'hôte, et si oui, comment ? Le nématode C. elegans offre un modèle pertinent pour aborder cette question. De nombreuses familles d'ET y ont été identifiées. Ses voies d'ARN interférent (ARNi) très diversifiées jouent un rôle central dans la répression des ET. Des analyses génomiques récentes menées sur des centaines de souches sauvages ont révélé une importante diversité génétique, offrant une opportunité sans précédent d'explorer la diversification naturelle des interactions hôte-éléments transposables (ET) et leur coévolution. En combinant des approches de génomique, de génétique, de biologie moléculaire et de bioinformatique, ce projet permettra de mieux comprendre les mécanismes de coévolution entre les génomes des hôtes et leurs parasites génomiques.
Activités :
Ce projet de doctorat vise à :
1. Explorer comment les éléments transposables ont remodelé les voies d'interférence ARN (ARNi) chez les C. elegans sauvages.
2. Tester si la variation naturelle des voies ERGO-1 explique les différences spécifiques à chaque souche dans le silencing des éléments transposables.
3. Analyser les mécanismes de régulation cis et trans sous-jacents à la variation d'expression des éléments transposables dans les souches sauvages.
Votre Environnement de Travail
Le doctorant intégrera une équipe de recherche collaborative spécialisée dans l'étude des éléments transposables, de l'interférence ARN, de l'évolution des génomes et de la génétique quantitative.
Contraintes et risques
Pas de risques particuliers
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€
À propos de l'offre
Référence de l'offre
UMR8197-VALHER-246
Section(s) CN / Domaine de recherche
Système Terre : enveloppes superficielles
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
Sujet De Thèse
Défense et contre-défense entre voies des petits ARN et éléments transposables chez Caenorhabditis elegans
Mission :
Les éléments transposables (ET) sont des parasites génomiques capables de se répliquer et se mouvoir au sein des génomes hôtes. Leur mobilisation constitue une menace persistante pour ces génomes. En réponse, les hôtes ont développé divers mécanismes de défense pour préserver l'intégrité de leur génome. Les interactions hôte-ET sont donc souvent perçues comme une course évolutive aux armements. Cependant, les ET peuvent être cooptés pour des fonctions de l'hôte et ont largement contribué à l'évolution des génomes. Des progrès considérables ont été réalisés dans la caractérisation de la dynamique d'invasion des ET et des voies de répression génique de l'hôte, mais très peu d'études répondent à la question suivante : les ET peuvent-ils contrer activement les mécanismes de défense de l'hôte, et si oui, comment ? Le nématode C. elegans offre un modèle pertinent pour aborder cette question. De nombreuses familles d'ET y ont été identifiées. Ses voies d'ARN interférent (ARNi) très diversifiées jouent un rôle central dans la répression des ET. Des analyses génomiques récentes menées sur des centaines de souches sauvages ont révélé une importante diversité génétique, offrant une opportunité sans précédent d'explorer la diversification naturelle des interactions hôte-éléments transposables (ET) et leur coévolution. En combinant des approches de génomique, de génétique, de biologie moléculaire et de bioinformatique, ce projet permettra de mieux comprendre les mécanismes de coévolution entre les génomes des hôtes et leurs parasites génomiques.
Activités :
Ce projet de doctorat vise à :
1. Explorer comment les éléments transposables ont remodelé les voies d'interférence ARN (ARNi) chez les C. elegans sauvages.
2. Tester si la variation naturelle des voies ERGO-1 explique les différences spécifiques à chaque souche dans le silencing des éléments transposables.
3. Analyser les mécanismes de régulation cis et trans sous-jacents à la variation d'expression des éléments transposables dans les souches sauvages.
Votre Environnement de Travail
Le doctorant intégrera une équipe de recherche collaborative spécialisée dans l'étude des éléments transposables, de l'interférence ARN, de l'évolution des génomes et de la génétique quantitative.
Contraintes et risques
Pas de risques particuliers
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€
À propos de l'offre
Référence de l'offre
UMR8197-VALHER-246
Section(s) CN / Domaine de recherche
Système Terre : enveloppes superficielles
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
