Publiée 21 août 2026
Doctorat portant sur l'étude des écosystèmes méditerranéens post-incendie H/F
Institut de Chimie Moléculaire de Reims
Reims, Grand Est 51687, France
CDI
Description du Poste
Sujet De Thèse
Si la résilience des plantes après incendie a traditionnellement été étudiée à l'échelle de l'organisme, des travaux récents suggèrent que les plantes et leurs communautés microbiennes associées constituent une entité fonctionnelle intégrée - l'holobionte végétal - dont les interactions chimiques et le métabolisme collectif jouent un rôle déterminant dans l'adaptation aux perturbations environnementales. Le projet MULTICHEM-HOLO propose de tester l'hypothèse selon laquelle la résilience post-incendie est une propriété émergente de cet holobionte, résultant d'interactions dynamiques entre la plante, son microbiome et leurs métabolites spécialisés. Pour répondre à cette question, il développera une approche intégrative combinant l'écologie chimique, l'analyse du microbiome, la métabolomique multimodale et l'intelligence artificielle afin d'identifier les signatures moléculaires de la résilience et de décrypter les mécanismes sous-jacents à la récupération des écosystèmes méditerranéens après un incendie.
o Activité 1 : campagnes de terrain seront menées dans des écosystèmes méditerranéens en Grèce et en France
o Activité 2 : Des tissus végétaux, la rhizosphère et les sols environnants seront prélevés sur des sites brûlés et non brûlés afin de caractériser la résilience écologique et d'étudier la diversité et la composition fonctionnelle des communautés microbiennes associées
o Activité 3 : profilage du microbiome, culturomique microbienne et métabolomique multimodale reposant sur la LC-HRMS/MS, la GC-MS/MS et des approches avancées de RMN
o Activité 4 : statistiques multivariées et apprentissage automatique afin d'identifier des biomarqueurs microbiens et chimiques de la résilience et de révéler les interactions reliant la composition du microbiome, le métabolisme spécialisé et la restauration écologique
o Activité 5 : établir une preuve de concept démontrant que l'holobionte est un élément fonctionnel impliqué dans la résilience des plantes après un feu de forêt
Votre Environnement de Travail
Thèse internationale impliquant 3 unités de recherche (ICMR et ECSN en France et NPMC à Athènes), campagnes de collectes sur le terrain en France et en Grèce.
Moyens mis à disposition (appareillage, informatique...) : Poste de travail informatique, logiciels spécifiques, plateforme analytique, laboratoire de chimie et de microbiologie
Principaux interlocuteurs (réseau relationnel intra ou extra CNRS) : JH RENAULT (ICMR), Véronique EPARVIER (ICSN), Maria HALABALAKI (NPMC, Athènes)
Contraintes et risques
La thèse conduira la personne recrutée à travailler au sein de trois équipes de recherche (Reims, Gif-sur-Yvette, Athènes) // Missions de terrain
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€
À propos de l'offre
Référence de l'offre
UMR7312-ELOMET-003
Section(s) CN / Domaine de recherche
Chimie et vivant
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
Sujet De Thèse
Si la résilience des plantes après incendie a traditionnellement été étudiée à l'échelle de l'organisme, des travaux récents suggèrent que les plantes et leurs communautés microbiennes associées constituent une entité fonctionnelle intégrée - l'holobionte végétal - dont les interactions chimiques et le métabolisme collectif jouent un rôle déterminant dans l'adaptation aux perturbations environnementales. Le projet MULTICHEM-HOLO propose de tester l'hypothèse selon laquelle la résilience post-incendie est une propriété émergente de cet holobionte, résultant d'interactions dynamiques entre la plante, son microbiome et leurs métabolites spécialisés. Pour répondre à cette question, il développera une approche intégrative combinant l'écologie chimique, l'analyse du microbiome, la métabolomique multimodale et l'intelligence artificielle afin d'identifier les signatures moléculaires de la résilience et de décrypter les mécanismes sous-jacents à la récupération des écosystèmes méditerranéens après un incendie.
o Activité 1 : campagnes de terrain seront menées dans des écosystèmes méditerranéens en Grèce et en France
o Activité 2 : Des tissus végétaux, la rhizosphère et les sols environnants seront prélevés sur des sites brûlés et non brûlés afin de caractériser la résilience écologique et d'étudier la diversité et la composition fonctionnelle des communautés microbiennes associées
o Activité 3 : profilage du microbiome, culturomique microbienne et métabolomique multimodale reposant sur la LC-HRMS/MS, la GC-MS/MS et des approches avancées de RMN
o Activité 4 : statistiques multivariées et apprentissage automatique afin d'identifier des biomarqueurs microbiens et chimiques de la résilience et de révéler les interactions reliant la composition du microbiome, le métabolisme spécialisé et la restauration écologique
o Activité 5 : établir une preuve de concept démontrant que l'holobionte est un élément fonctionnel impliqué dans la résilience des plantes après un feu de forêt
Votre Environnement de Travail
Thèse internationale impliquant 3 unités de recherche (ICMR et ECSN en France et NPMC à Athènes), campagnes de collectes sur le terrain en France et en Grèce.
Moyens mis à disposition (appareillage, informatique...) : Poste de travail informatique, logiciels spécifiques, plateforme analytique, laboratoire de chimie et de microbiologie
Principaux interlocuteurs (réseau relationnel intra ou extra CNRS) : JH RENAULT (ICMR), Véronique EPARVIER (ICSN), Maria HALABALAKI (NPMC, Athènes)
Contraintes et risques
La thèse conduira la personne recrutée à travailler au sein de trois équipes de recherche (Reims, Gif-sur-Yvette, Athènes) // Missions de terrain
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€
À propos de l'offre
Référence de l'offre
UMR7312-ELOMET-003
Section(s) CN / Domaine de recherche
Chimie et vivant
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
